MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid PL23

Total Repeats: 548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007428	CGA	2	6	147	152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007428	AAC	2	6	279	284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007428	TCG	2	6	369	374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007428	TGG	2	6	456	461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007428	CGA	2	6	515	520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007428	GTCGA	2	10	529	538	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007428	GAA	2	6	579	584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007428	CG	3	6	585	590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007428	GCG	2	6	593	598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007428	GCT	2	6	648	653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007428	TGC	2	6	685	690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007428	ACA	3	9	720	728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007428	GT	3	6	749	754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007428	GGT	2	6	772	777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007428	TCG	2	6	839	844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007428	CTG	2	6	846	851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007428	GCCG	2	8	896	903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007428	TA	3	6	926	931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007428	ACG	2	6	958	963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007428	TA	3	6	991	996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007428	GAAC	2	8	1004	1011	50 %	0 %	25 %	25 %	76803318
22	NC_007428	CGA	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803318
23	NC_007428	CAAG	2	8	1052	1059	50 %	0 %	25 %	25 %	76803318
24	NC_007428	GAG	2	6	1096	1101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803318
25	NC_007428	CGC	2	6	1114	1119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803318
26	NC_007428	CCCG	2	8	1174	1181	0 %	0 %	25 %	75 %	76803318
27	NC_007428	CTG	2	6	1195	1200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803318
28	NC_007428	TGC	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803318
29	NC_007428	AGC	2	6	1242	1247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803318
30	NC_007428	TACCA	2	10	1294	1303	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_007428	AGAGC	2	10	1305	1314	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007428	GTCT	2	8	1337	1344	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007428	ACGA	2	8	1432	1439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007428	ATATA	2	10	1458	1467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007428	AG	4	8	1637	1644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007428	TGAG	2	8	1690	1697	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007428	ACC	2	6	1747	1752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_007428	TAG	2	6	1771	1776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007428	GGAC	2	8	1942	1949	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007428	AGCC	2	8	1996	2003	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007428	GTC	2	6	2057	2062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803319
42	NC_007428	TGC	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803319
43	NC_007428	GATCG	2	10	2105	2114	20 %	20 %	40 %	20 %	76803319
44	NC_007428	TG	3	6	2174	2179	0 %	50 %	50 %	0 %	76803319
45	NC_007428	CCA	2	6	2190	2195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76803319
46	NC_007428	ACT	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803320
47	NC_007428	CGT	2	6	2465	2470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803320
48	NC_007428	GCCG	2	8	2490	2497	0 %	0 %	50 %	50 %	76803320
49	NC_007428	CTC	2	6	2586	2591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_007428	CG	4	8	2594	2601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007428	C	6	6	2646	2651	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_007428	CGTA	2	8	2748	2755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007428	CCG	2	6	2775	2780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_007428	CG	3	6	2855	2860	0 %	0 %	50 %	50 %	76803321
55	NC_007428	CCT	2	6	2931	2936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803321
56	NC_007428	CGT	2	6	3000	3005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803321
57	NC_007428	GTC	2	6	3013	3018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803321
58	NC_007428	GTA	2	6	3091	3096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803321
59	NC_007428	TGG	2	6	3108	3113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803321
60	NC_007428	CTT	2	6	3124	3129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803321
61	NC_007428	AGT	2	6	3168	3173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803321
62	NC_007428	TCC	2	6	3203	3208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803321
63	NC_007428	GTTCGA	2	12	3286	3297	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	76803321
64	NC_007428	CGG	2	6	3299	3304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803321
65	NC_007428	TCC	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803321
66	NC_007428	TCG	2	6	3333	3338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803321
67	NC_007428	GTC	2	6	3392	3397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803321
68	NC_007428	CAG	2	6	3452	3457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803321
69	NC_007428	GAA	2	6	3547	3552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803321
70	NC_007428	GCT	2	6	3584	3589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803321
71	NC_007428	TCGG	2	8	3590	3597	0 %	25 %	50 %	25 %	76803321
72	NC_007428	CGG	2	6	3627	3632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803321
73	NC_007428	CTCC	2	8	3706	3713	0 %	25 %	0 %	75 %	76803322
74	NC_007428	CAT	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803322
75	NC_007428	ATC	2	6	3783	3788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803322
76	NC_007428	GCG	2	6	3791	3796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803322
77	NC_007428	CG	3	6	3803	3808	0 %	0 %	50 %	50 %	76803322
78	NC_007428	CTT	2	6	3828	3833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803322
79	NC_007428	TCG	2	6	3841	3846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803322
80	NC_007428	CGT	2	6	4004	4009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803322
81	NC_007428	TCG	2	6	4021	4026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803322
82	NC_007428	CGT	2	6	4043	4048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803322
83	NC_007428	GGC	3	9	4062	4070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803322
84	NC_007428	ATC	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803322
85	NC_007428	TCG	3	9	4195	4203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803322
86	NC_007428	GTC	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803323
87	NC_007428	GCC	2	6	4261	4266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803323
88	NC_007428	GCT	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803323
89	NC_007428	CGG	2	6	4415	4420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803323
90	NC_007428	ATTG	2	8	4443	4450	25 %	50 %	25 %	0 %	76803323
91	NC_007428	CCGT	2	8	4671	4678	0 %	25 %	25 %	50 %	76803324
92	NC_007428	CGG	2	6	4684	4689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803324
93	NC_007428	GAT	2	6	4693	4698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803324
94	NC_007428	AGG	2	6	4761	4766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803324
95	NC_007428	GTC	2	6	4781	4786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803324
96	NC_007428	TGC	2	6	4810	4815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803324
97	NC_007428	GCT	2	6	4822	4827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803324
98	NC_007428	GTTG	2	8	4840	4847	0 %	50 %	50 %	0 %	76803324
99	NC_007428	CTG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803324
100	NC_007428	CTT	2	6	4870	4875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803324
101	NC_007428	CGT	2	6	4905	4910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803325
102	NC_007428	GCGA	2	8	4943	4950	25 %	0 %	50 %	25 %	76803325
103	NC_007428	GC	3	6	4970	4975	0 %	0 %	50 %	50 %	76803325
104	NC_007428	CCGT	2	8	4986	4993	0 %	25 %	25 %	50 %	76803325
105	NC_007428	CGG	2	6	4999	5004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803325
106	NC_007428	GAT	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803325
107	NC_007428	GGT	2	6	5105	5110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803325
108	NC_007428	GCA	2	6	5141	5146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803325
109	NC_007428	GCT	2	6	5152	5157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803325
110	NC_007428	TCG	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803325
111	NC_007428	CTT	2	6	5200	5205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803325
112	NC_007428	ACT	2	6	5253	5258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007428	CA	3	6	5269	5274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007428	CGT	3	9	5298	5306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803326
115	NC_007428	TGC	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803326
116	NC_007428	CAT	2	6	5388	5393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803326
117	NC_007428	TCG	2	6	5429	5434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803326
118	NC_007428	GGC	2	6	5442	5447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803326
119	NC_007428	GCT	2	6	5528	5533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803327
120	NC_007428	GCG	2	6	5538	5543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803327
121	NC_007428	TCG	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803327
122	NC_007428	GTG	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803327
123	NC_007428	CGT	2	6	5657	5662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803327
124	NC_007428	CGC	2	6	5663	5668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803327
125	NC_007428	CCG	2	6	5757	5762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803327
126	NC_007428	CGA	2	6	5768	5773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803327
127	NC_007428	AGC	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803328
128	NC_007428	CAG	2	6	5863	5868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803328
129	NC_007428	GCT	2	6	5881	5886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803328
130	NC_007428	CAA	2	6	6069	6074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803328
131	NC_007428	GCT	2	6	6111	6116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803328
132	NC_007428	GGC	2	6	6122	6127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803328
133	NC_007428	GCCG	2	8	6248	6255	0 %	0 %	50 %	50 %	76803328
134	NC_007428	TCC	2	6	6259	6264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803328
135	NC_007428	GAG	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803328
136	NC_007428	GCC	2	6	6275	6280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803328
137	NC_007428	CGC	2	6	6300	6305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803328
138	NC_007428	GAA	2	6	6324	6329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803328
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269	NC_007428	GGC	2	6	11637	11642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803338
270	NC_007428	GCT	2	6	11701	11706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803338
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272	NC_007428	CTTC	2	8	11733	11740	0 %	50 %	0 %	50 %	76803338
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280	NC_007428	CCGC	2	8	12058	12065	0 %	0 %	25 %	75 %	76803339
281	NC_007428	CGGAA	2	10	12100	12109	40 %	0 %	40 %	20 %	76803339
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303	NC_007428	CGA	2	6	13127	13132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803339
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393	NC_007428	AAG	2	6	16245	16250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803340
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396	NC_007428	CGA	2	6	16297	16302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803340
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